Als erstes würde ich dir empfehlen, noch einmal in Ruhe und mit etwas Abstand mit deinem Fahrlehrer zu sprechen. Er soll dir erklären, wo diese Ampel ist und notfalls sogar hinfahren. Außerdem soll er dir mal, wenn er beim TÜV Online registriert ist, mal zeigen, was der Prüfer als offiziellen Durchfallgrund angegeben hat (kann man online auslesen). Sollte er das nicht machen wollen, fahr direkt zum TÜV (zur Hauptstelle in deiner Nähe) und frage nach.
Wenn dir das ganze anschließend immer noch suspekt vorkommt, kannst du natürlich auch die Fahrschule wechseln (ohne großen Aufwand). Würde ich zumindest machen, wenn das Vertrauen zum Fahrlehrer nicht mehr vorhanden ist.
Beschweren ist allerdings nicht ganz einfach, da die Gremien, die die Prüfung abhalten (Fahrlehrer und TÜV), sich nicht gerne "selbst anpinkeln".
Möglichkeiten hast du über die Führerscheinstelle, den zuständigen Fahrlehrerverband und über den zuständigen TÜV. Dort solltest du dich entweder an den nächsten Vorgesetzten wenden oder direkt sich an den Vorstand wenden.
Ach ja, eine Prüfung muss bei kleinen Fehlern nicht gleich abgebrochen werden. Meistens wird der Prüfer versuchen, den Prüfling noch einmal in eine solche Situation zu lotsen, um zu sehen, ob er den Fehler noch einmal macht. Außerdem muss er eine Prüfung nicht sofort abbrechen, selbst wenn ein grober Fehler aufgetreten ist. Er kann dann immer noch den Prüfling zurückfahren lassen. Außerdem ist es auch für den Prüfling, grade auf dem Motorrad, besser es nicht sofort zu wissen, da er anschließend sicher nur noch unkonzentriert ist. Sollte der Prüfer allerdings das Gefühl haben, das der Prüfling sein Gefährt nicht unter Kontrolle hat, kann er die Prüfung auch sofort abbrechen.
Da ich in einer Fahrschule arbeite, habe ich allerdings auch schon häufig von Fahrschülern gehört, das sie aber auch gar nichts falsch gemacht haben und der Prüfer sie durchfallen lassen wollte. Spricht man anschließend mit dem Fahrlehrer drüber, kann man auch die andere Seite hören und da sieht die Sache schon ganz anders aus

. Die wenigsten gestehen sich dann auch die Fehler ein und suchen nur einen Sündenbock - irgendwer muss ja schuld sein und der Fahrschüler ist es NIE.
Trotzdem wünsche ich dir, dass du rausfindest was schief gelaufen ist.